七. 出任行政院长
到１９４８年底，阎锡山深知大势将去，一方面开始为自己安排退路，另一方面又向下属表示要与太原城共存亡。１９４９年１，２月间，阎锡山接见几名外国记者，指着桌上一些装有 的小瓶说：“我决心死守太原，与城共存亡，太原如果不守，我就和这些小瓶同归于尽”。他还将-的扶乩生王某请到家中扶乩。扶乩结果是“飞虎队就要到来。”“太原城有祖师爷保护”。阎则借以稳定军心。不久，蒋介石要阎锡山放弃太原，速退西安。担任西北行营主任，负责指挥西北各处重责。干部由陈纳德用飞机接走。军队尽量西渡。在放弃太原前，将兵工厂炸毁。但阎不同意这件事，仍然表示要坚决固守太原。
与此同时，阎锡山通过在南京的杨爱源向代总统李宗仁和美驻华大使司徒雷登及陈纳德等人联系，由他任行政院长，何应钦任-长，白崇禧任参谋总长。打算在太原不能保时，飞往南京任行政院长，太原形势缓和时，仍统治山西。但就在他的安排就要实现时，李宗仁改变了态度，发表由何应钦为行政院长，并请贾景德电阎，告以阎的名望很高，不敢以行政院长委屈，正筹划崇高名义。贾景德在电中相告，行政院长既以发表何应钦，当然副院长一席未便曲就，容图再想办法。阎接电后，甚为生气。但因解放军已迫进城下，乃复电贾景德云：“为了拯救晋民，名位高下，在所不计，虽副席亦可也。”
随着太原形势紧张，阎锡山变得终日心神不定，坐卧不宁。阎锡山平时待人和蔼，但此时却暴躁不安，手里常拿一根木棍，不论亲信和部属，见人就想打，请示或回答公事的人员，见了就要骂。除了过问郊区的战况和运输粮食的飞机情形以外，其他事件，一律不愿过问。这种情形，据他周围的人说，是三十多年从未见过的。
就在部属不知该怎么办时，阎锡山突然于３月２９日下午笑容满面地召集他们开会。他极其和蔼地对秘书长吴绍之说：“你把李代总统的电报念给大家听听”。原电为：“和平使节定于月初飞平，-大事，待我诸公前来商决，敬请迅速命驾。如需飞机，请即电示，以便迎接，宗仁，俭印”（３月２８日）。电报念完，阎徵求大家意见，谈约半小时，有人默不作声，也有人说：“此次赴京开会，应在南京多住些日子。”阎锡山说：“也许三五天，也许十天八天，等和平谈判有了结果，我就回来”。正在这时，梁化之插嘴说：“天气已经不早了，飞机在机场等候，请早动身吧。”阎不要大家相送，立即起身，乘坐汽车，风驰电掣地由绥靖公署直奔郊外圪燎沟机场，除梁化之和阎的五妹阎慧卿到飞机场送行外，其余人员均送到大门口，作了几十年共事的最后一次死别。
阎到机场后，在解放军大炮的射击下，匆匆登机，飞离太原，去往南京。
阎锡山到南京的第二天拜访了李宗仁，对太原的防守作了汇报。李对他说：“你休息几天吧，暂时不必回去”。阎也就借此不再提回太原的事了。
四月中旬，国民政府行政院长何应钦召开秘密会议，讨论中共１月１４日提出的和谈八项条件。阎锡山说，条件的实质是难以接受的，即使接受了，以后也难以解决问题。他还亲赴溪口和蒋介石面商，谓李宗仁进行的和谈，决不会成功。到和谈破裂时，他愿拥蒋再度出山，由他任行政院长，扭转败局。
南京被解放军攻克后，广州成为国民政府临时首都，阎锡山也到了广州，并和ＣＣ系联合发起成立了“反侵略大同盟”。国家主义派、民社党也参加其中。该大同盟虽然昙花一现。但却为阎创造了有利条件。这时行政院长孙科在内外交困下辞职。李宗仁想让自己人居正担任行政院长，组成以桂系为中心的内阁。蒋介石怕不能操纵政府，反对居正出任行政院长，但又不便让自己的亲信来出任。这就给阎锡山提供了一个好机会。居正一被否决，阎锡山便以守城“名将”的名声和坚决-的态度，在ＣＣ系的大力支持下，于１９４９年６月３日担任了国民政府的行政院长。
阎锡山上任后，先飞到台湾见蒋介石，然后到桂林同李宗仁商议，发表了组阁名单。以朱家骅为副院长，其余-、财政部等要害部门都未曾变动，还是蒋介石的原班人马。阎锡山将自己的亲信贾景德任命为行政院秘书长，王平为财政部次长，方闻为总务司长。６月１５日他首先提出一个“扭转时局方案”，规定后方几省成立“-救国总司令部”，由省主席兼任总司令。７月１日，又制定“全国作战计划”，以重庆为军事枢扭，以台湾为作战基地。７月６日，他又与陈纳德商定，重组“飞虎队”。７月７日，阎锡山和蒋介石、李宗仁等，以及青年党，民社党负责人和胡适，于斌等９８人，借纪念“七七事变”之际，在广州联合发表“-救国宣言”，声称要“集中力量，坚持战斗”。７月１２日，行政院颁布“-公约”，规定五家连坐，互相监督，检举。８月３日，国民党临时成立的决策机构“非常委员会”，通过了阎锡山提出的“-救国方案。”
这时，东北、华北已全部解放，湖南程潜亦表明愿意和平解放的态度。但阎锡山仍希望在湘粤间阻挡解放军南下；同时，他派出许永昌到绥远游说董其武不要随同傅作义响应和平解放，并调开甘肃省主席郭寄峤，将甘肃军政大权完全交给马步芳，以图巩固大西北。他还对云南的龙云表示希望西南不要有什么变化。但事于愿违，绥远在徐永昌离开几天后便宣布起义。西北的马家军也很快被解放军击溃，兰州于八月解放。粤北的韶关、英德相继落入解放军手中。在这种情况下，国民政府于８月８日由广州迁往重庆。接着福州、兰州、银川相继被解放军攻克，新疆和平解放。
１０月１４日，李宗仁和阎锡山在广州被攻克后飞往重庆。１０月１６日，阎锡山在四川推行总体战，制定“军政一元化”的作战方案。但解放军入川作战，进展神速。阎锡山又于１１月２８日飞往成都。在成都，他又兼任国民党教育部成立的“-救国战斗团”的团长。１９４９年１２月８日，在成都被解放军占领前夕，阎锡山飞往台湾。
八. 临终留谜
１９５０年３月，蒋介石在台湾再次出任总统。陈诚继任行政院长。阎锡山从此逐渐退出政治舞台，其职位是-资政和国民党中央评议委员。这时的阎锡山，住在阳明山之菁山，深居简出，很少参加公开活动。这里原是日本人没有完工的一个农场。没有公路，自来水，也没有电灯电话。阎锡山为躲避炎热和台风，打了一个石窑洞，起名“种能洞”，住在这里，每日埋头写作。他先后出版了《世界和平与世界大战》，《共产主义的哲学和共产党的错误》，《收复大陆与土地问题》，《-复国的前途》等著作。１９５９年，香港《真报》记者和他谈重返大陆的问题，他说：“一旦能配合国际形势，王师跨海北进，直捣黄龙，毫无问题。诸位别看我阎锡山老态了，真个一旦-号响，看吧，我还要请求率领健儿们再打几个胜仗给国人看看；我有信心，生从太原来，我这把老骨头仍将活着回太原去”。
但此时的阎锡山心里一定很明白，他不会再看到生他，养他的故乡了。就在这次谈话后不久。阎锡山于１９６０年５月２３日病逝于台北寓所，享年７７岁。
病重时，阎锡山对一直看护他的贾景德说：他痛惜自己不能追随蒋介石回大陆去，而深感遗憾。阎给其亲属留下了六点遗嘱：一、一切宜简，不宜奢；二、收挽联不收挽幛；三、灵前供无花之花木；四、出殡以早为好；五、不要放声而哭；六、墓碑刻他的日记第一百段及第一百二十八段；七、七日之内，每日早晚各读他选作之《补心录》一遍。
生前，阎锡山还自作挽联数幅，嘱家人在他死后，贴在指定位置。贴在灵前的是：“避避避，断断断，化化化，是三步功夫；勉勉勉，续续续，通通通，为一笔事功”。横幕为“朽［目真］化欲”。贴在檐柱前的为：“摆脱开，摆脱开，沾染上洗乾净很不易；持得住，持得住，掉下去爬上来甚为难”。横幕为：“努力摆持”。贴在院中的为：“有大需要时来，始能成大事业；无大把握而去，终难得大机缘”。横幕为：“公道爱人”。贴在院门上的为：“对在两间，才称善；中到无处，始叫佳”。横幕为“循中蹈对”。中间两幅较易为人理解。对前后两幅，凭吊者往往莫明其妙，不解其意。有人说“阎一生喜弄玄机。临终还留此谜联，让人动脑筋”。
阎锡山病逝后，台湾成立了以何应钦为首的治丧委员会。委员有于右任、张群、贾景德、唐纵、李石曾、张道蕃、谷正鼎、谷正伦、梁寒操等人。５月２９日入敛，蒋介石亲往祭奠，并送一块“怆怀耆勋”的匾额。随后葬于阳明山七星山之上。
阎锡山所处的时代，正是中国最混乱的时期。多少风流人物在这个历史的大舞台上演出了一幕幕悲喜剧。有的人象流星一样很快就消失了。而阎锡山在清王朝末期、辛亥革命、北洋军阀、国民政府及国民党退据台湾的最初十年等几个时期，总是扮演着一个引人注目的角色，功过自有评说, 但阎锡山在近代中国政坛上的“不倒翁”形像，为阎的一生及他的时代提供了一个注解。
